补充协议是指在主合同履行过程中，由于各种原因需要对原合同中约定的内容进行修改、变更或补充，以达到更好的合作目的的协议。补充协议对于商业合同的签署非常普遍，它不仅能够有效规范合同关系，增加合作方的互信，还能保证双方的合同权利义务。
那么，补充协议是否能够增加新主体？答案是肯定的。在某些情况下，因为主合同中的条款并未涵盖到每一个利害关系人，补充协议可以使得原先未参与主合同的新主体加入到合同关系当中。这种情况下，新主体需要对原主合同中的内容进行知晓和确认，并同意在补充协议中承担相应的权利和义务。
在确定新主体之后，应按照法律程序进行签署协议的步骤。具体应该包括以下步骤：
第一步、确定补充协议的范围：要明确补充协议的改变点，以及它的目的、必要性、实施时间、权利义务和违约责任等。经过认真协商之后，双方确定一致的意见，才能进行下一步。
第二步、起草补充协议：协议草案应当由注册专业律师或法律顾问撰写。草案应包括各方的名称、地址、联系方式、权利、义务以及其他协议重点内容。协议书一经草拟完成，需及时提交给协议方进行确认及修改。
第三步、会议确认：在协议书草拟完成后，双方应通过会议、电子邮件或书面形式通知协议对方，涉及新主体的补充协议需在会议中进行确认。
第四步、签署补充协议：经过会议确认后，合同的签署程序就可以开始进行了。在签署补充协议时，各方应当仔细阅读协议内容，由合法代表人代表各方签字并盖章，以作为协议的正式合法文件，缔结新主体的合同关系。
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第五步、保存及执行：签署协议后，各方应当妥善保管协议书，并按照约定履行协议义务。如果协议的内容违反法律规定或混淆了公共秩序和社会道德，应当及时修正，以及时纠正协议的错误所在。
总之，补充协议是商业合同中为数不多的灵活变通方式之一，能够使未参与合同的新主体加入到协议关系中，从而保证协议的实施效果，增强协议的灵活性和完整性。只有严格遵循法律程序，签署具备合法合规素质的补充协议，才能保护合同双方的权利利益，防止出现后患。